Головні герої, під командуванням безстрашного капітана Юузу Окіта, Сусуму Кодай та Дайсуке Сіма, відправляться у недосліджений космос, де їх чекатимуть ворожі кораблі та інші небезпеки, які вони мають пережити на борту Ямато і виконати свою місію: зберегти людство перш ніж буде занадто пізно.
