Au milieu de l'Atlantique, un navire américain est approché par un objet volant non-identifié. Le docteur Molly Anne Caffrey, analyste de l'inattendu, est immédiatement contactée par la Sécurité Nationale pour activer le plan Threshold, un protocole d'urgence prévu par le gouvernement en cas de présence extraterrestre. Sous la responsabilité de J.T.Baylock, Molly prend la direction d'une équipe de spécialistes afin d'analyser le phénomène et de déterminer s'il constitue une menace pour l'humanité...